O Anki é um Spaced Repetition System, ou SRS. Trata-se de um sistema parecido com flashcards com uma diferença fundamental:  no SRS as cartas não aparecem aleatoriamente e sim de forma controlada. Você vê a carta, depois seleciona a dificuldade na qual a entendeu (fácil, difícil…), de acordo com a sua dificuldade ele repete a carta um número maior de vezes.
No Anki você pode estudar kanji e palavras isoladas ou frases inteiras, o que eu acho muito melhor, principalmente para não confundir. E ele já conta com vários plugins para estender suas funcionalidades que podem ser baixados gratuitamente.
O Anki é gratuito e você pode pegar sua versão mais recente clicando aqui.
Eu ia fazer um tutorial explicando todo o funcionamento do Anki, mas achei um ótimo tutorial na net que embora esteja explicando com uma versão mais antiga do Anki dá para você entender bem o potencial e o funcionamento do mesmo. Para  acessar o tutorial clique aqui.